Los precedentes más remotos de la actual Facultad de Náutica se encuentran en la segunda mitad del siglo XIX al delimitarse más claramente las competencias de los marinos civiles y militares, momento en el que desaparece la Escuela Departamental de Cádiz, aunque la Armada seguirá con la atribución de los exámenes. En el año 1.852, la Escuela se integra en un centro mayor, la Escuela de Industria y de Comercio. Este centro politécnico englobaba, junto con los estudios de Ciencias Náuticas, los de Química, Mecánica y Peritos Mercantiles. Durante el siglo XX las Escuelas Oficiales de Náutica se consolidarán como Escuelas Superiores de Marina Civil, dependientes del Ministerio de Transportes. Las integraciones de las mismas en las Universidades españolas se producen a partir del año 1.988. Respecto de la Escuela de Cádiz, esta pasa a integrarse orgánicamente en la Junta de Andalucía, en el 1.990, a través de la Universidad de Cádiz, llamándose a partir de ese momento Facultad de Ciencias Náuticas. Posteriormente, cuando se reformaron los estudios que se ofrecían se denominó Facultad de Náutica y finalmente se designó como Escuela de Ingenierías Marina, Náutica y Radioelectrónica como consecuencia de la entrada en vigor de los Grados.